水晶的五大特质——记忆、储存、扩大、转换、聚焦
刚买来的水晶，由于水晶会记忆所有何它接触过的人事物，因此一块水晶原石可能保留了采矿工人，矿主，商人，搬运工人，零售商或雕磨师父等等的记忆，也许有些不好的记忆，甚至会影响到水晶拥有者，所以要净化，天然水晶一定要与水晶拥有者亲自帮它净化才有用，否则就白废力气，且也不要相信所谓的大师加持，他们都只会趁机坑你钱呢！
水晶戴久了，或是使用水晶疗法，容易吸引负性能量，所以也要做水晶的净化喔！也有人称消磁法！可以恢复原来的磁常一般来讲净化时间约１个月一次就可以了！如果是用来治材话，每星期就要净化一次。还有，当水晶摸起来有粘腻感，就记得要赶快净化了！
日光净化法：利用阳光直接照射，最好在早上到中午前左右的阳光是最适当，约２小时，如果不小心超过时间也没关系，但是一定要在日落前收回来。（紫晶和粉晶不宜！会褪色）
月光净化法：听说最好用满月时晒比较好（利用日、月之阴阳离子消磁法最好，既可消磁，又可增强水晶能量）。
泡盐水：要用海盐，也就是粗盐，用干净无污染的水去泡一晚，隔天再用干净的水冲干净，此法对于有金属或绳子的水晶来说，要少用，因为盐会侵蚀金属或绳子喔！干净的水可以选用一般的矿泉水或RO逆渗透或蒸馏水都可以。
亲近自然法：出游时，将水晶放在溪水中让它接近大自然，补充能量。
埋入土中：可以利用干净不会有污水流过的泥土，埋入约３－１０天，因为土壤是具有生育的强力能力，而可以夺取毒素，并吹入巨大的能量；如果担心脏掉，可用植物纤维的布料予以包扎，再埋入土里。
埋入雪中：这也可以，只要是干净的雪，在大自然中的雨、雪、光、溪水等等，都可以让水晶净化。
利用晶簇：放在晶簇、晶洞中，利用品簇、晶洞释放之正磁场清除水晶的负能量，让它重新充电，放置时间约一晚左右即可。
天然水晶六角晶柱净化：六角晶柱他的尖端部份气场特别强，可以使用四根六角晶柱来作净化，也属于很有效的净化方式之一。首先，将四根六角晶柱的尖端朝内摆，四根分别摆饰方位，分别如东西南北这样的摆置，中间的位置则放置要净化的水晶，如此摆置一晚就可以了。
植物精油共振：采用与该水晶可以共振的植物精油，利用薰香瓶加热精油熏蒸（把水晶至于薰香瓶镂空盖上方2厘米左右处）水晶1小时，这是非常好的重新赋予宝石能量的方法。参见：水晶与植物精油的共振（一）、水晶与植物精油的共振（二）。
补充：
净化水晶的过程，虽然海盐效果奇佳，但正负能量一并消磁，海盐净化除必要性外尽量少用。比如用黑曜岩带右手常用来吸收身体排出的负能量、吸收病气，则用海盐净化比较合适；左手带黄水晶用来求财，则不该用海盐净化。
生病或情绪不佳时，会传递不佳的频率在水晶上，如果可以，最好暂时不戴水晶，当情绪好转或身体健康时赶快把水晶净化，免得较多的负能量与身体有过久的共振。
虽然有净化过，往家里某个位置一放，就经年累月不管了，常看到水晶上沾满了灰尘，甚而蜘蛛网，这中间若有过不愉快、吵架，保证频率会被水晶吸收且放大转换输出，本来偶尔吵架，买了水晶之后，变成常吵架，本来是应该善用水晶来改善家庭频率，水晶却变成负面的影响力，所以要每一个多月就净化一次。
家中的卧室应避免摆放水晶，除紫、白、粉三种水晶且尽量是呈水晶球或圆串珠，其余水晶不宜放在卧室。
水晶是不是能袪病？
事实上，这不应该是个问题，这已经是千百年来，古今中外许多人士的共同「实践」（Practice）结果，共同经验，就像是许多民俗疗法中的针灸、拔罐、推拿、刮痧等等，您要真说出它的道理，非常深奥，但您在实行它时，却又非常简便有效。就是这种原因，会让这种功夫流传下来千百年，而不会灭绝。
中国在古代就有「砭石」的使用，美洲迂安人亦有使用水晶的悠久历史，在世界各地的许多不同民族、文化、传统，也都有使用石头治材例子，篇幅有限，不胜枚举。这些，其实都是「水晶疗法」（Crystal Healing）的滥觞。 再看人体，人不是只有物质化的肉体（Physical Body）而已，人还有非常精微的能量体（Energy Body），您可以称之为精神（Psychic）、心智（Mind）、心灵（Spirit）、灵魂（Soul），或是像是中国传统观念里的三魂七魄……而所有的这些，都是息息相关的，也根本就是一体的。
所以，人若生病，绝对不是说生病，就马上生材。他常常会从能量体上的变化开始，如果人还不能警觉，即时改正，这些负能量（Negative Energy）就会累积、变浓、变稠，并从能量气体的型态，渐渐变成物质固体的型态，到此，就是真正的发病了。到此，眼睛看的到了，手也触摸的到了，西医才有办法来接手。在此之前，他们是没有办法的，是束手无策的。
可是，一个人从开始感觉一点点不舒服，要一直拖到发病才来治疗，这过程是否太辛苦了？就好像有轻微的风寒之时不治疗，一定要等到变成肺炎才来治疗，那不是受罪吗？不是自讨苦吃兼玩命吗？其实，所有的民俗疗法，包括水晶疗法，就都是在做发病之前的能量医疗。当您还是小毛并小疼痛时，当您的病症还是在能量体、气体的型态时，就以相对的能量来对治了，不让它有机会变成物质的固态来发玻
水晶有它的疗效，就像是所有的民俗疗法也有它们的疗效一样，但是在此要强调一点的就是，「治疗疾补是一项非常专门的学科，也是对生命非常关键的一种技能，所以，若是生病了，「一定先给专业的医生看９有重大的疾病，甚至要给两位以上，或不同系统的医生（如西医、中医）来看，个人才能得到最佳的建议与照顾。不是一有病就找水晶，一有病就找各种的偏方疗法……
我们对水晶疗法的使用范围是建议，在真正发病之前的「微恙」、轻微的不舒服，或是在重病以後，医生已经宣布他也没办法了，此时，就不妨用水晶来试试看，或许，还有令人意想不到的效果哦。
综合前面各章所述，各种不同颜色的水晶会产生不同频率的能量，也会对人体气场产生相对的影响。利用此种办法，确实可以影响、改变一个人的「情绪」。因为情绪就是一个人体内的能量嘛！想要做到「情绪管理」，却不知如何下手，心里面明白应该要如何，可是就偏偏做不到……遇有这种困扰，请您掌握不同颜色的水晶矿石，并对之以静心冥想个三、五分钟，再试著观照您内心的忧愁、烦恼、忌妒、怀疑、生气、报复等等心态，是不是产生改变了呢？这种实验非常简单，又非常有趣。既然有千千万万的人都使用过，也成功的改变了他们自己的情绪，您为何也不试试看呢？
如何感应水晶的气，这是一个大课题，也是一项大的挑战！
因为，水晶的气就是看不到、听不到、一般人也摸不到；目前，也没有理想的科学工具、仪器可以定量、定性的来测量它的气，所以，也有许多人是根本不认为水晶有气的。
还好，这世界还有为数不少的人们，体质比较敏感，他们能够凭著身体的敏感度来感应（Sense）到水晶的气，并且大声说出来，让许多人不得不重视这个事实。这项功能的基本道理，就在於这些人的「气脉」比较开通，所以就容易感应到外气；所谓「气脉」，也就是一个人体内的经络、气穴、脉轮，简单的说，也就是一个人体内的「能源系统」。
什么样的人气脉会比较开通、敏感呢？一般而言，孩童比大人们好，女人家们又比男人们好，思想开放、具接受性的人又比固执、领导欲望强的人好；总而言之，常常在静心、打坐、持咒、念佛、祈祷、瞑想、链气功、打太极等等的人，他们的气机容易发动，气脉容易开启，所以也比较敏感，可以感受到外气。
在过去的时代里面，这就是叫做「修行」、「修炼」罗！修行的最根本，就是要修自己的能量；而最基茨入手，就要打开气脉。而光是要打开气脉这项功夫，可能就要花费数年、或是数十年的功夫了！
在西藏密宗的修行体系里面，有一种法器，叫做「钵」，这是由七种金属所调配、熔链制成的，有黄金、白银、镍、铜、锡、锑、铁，其中的镍和铁，就是由「镍铁陨石」（天铁）所提供的。从敲击、摩擦这种钵，可以产生「嗡！嗡９的声波，再跟著这种声波来持咒、念经、唱诵，人声可以和钵的声音产生共鸣作用，从而将人体体内所有的经络、气穴、脉轮迅速打开，教人有迅速成就的功效。如今，这种的钵虽然数量极少，详细作法也不清楚，但是相同的观念却流传了下来。